为什么佛教会设立这三种忏法呢？这是有它的原因的。这三种忏法各有它所依的原理，和它所要对治的对象。例如：作法忏是依戒而设立的忏法，它所要忏悔的是遮罪；取相忏是依定而设立的忏法，它所能忏除的，通于各种恶业；无生忏是依慧而设立的忏法，它要忏除的是最重要的性罪和罪根。智者大师在《释禅波罗蜜》卷二说：
“今明忏悔方法，教门乃复众多。取要论之，不过三种：一、作法忏，此扶戒律，以明忏悔；二、观相忏悔，此扶定法，以明忏悔；三、观无生忏悔，此扶慧法，以明忏悔。
一、作法忏的所依所治
先来解释作忏法的所依和所治。
忏悔，是针对过错而设的，如果一个人没有过错，根本就用不著忏悔。有了过错，也才有恶业；造了恶业，自然就形成罪业。罪业是会令人感受到难过与痛苦的。这难过与痛苦，更是会从现在存于内心上而延续到未来——包括今世，以及未来世。为了要消除现在和未来的痛苦，所以，才有了忏悔的设立。
那么，我们怎能知道，自己有没有过错？在什么时候造了罪业，成了有罪之身呢？这在出家众，很容易了解，他们有戒律作为身心的规范，如果犯了戒，便是行为有了过错；犯了戒，自然的，也就产生了戒律，又叫做“遮罪”。
遮罪就是指：有些行为对社会上的人来说，并没有罪；但是，对出家受过具足戒的比丘、比丘尼们，却是有罪的。譬如：为青年男女作媒或饮酒、贸易买卖……等等，出家戒中规定，比丘、比丘尼不可以有这些行为，以免引起社会上人的讥谤。既然受了出家戒，就必须守持；受戒而犯戒，在戒律上来说，便是一种过失，也是一种罪业，自然的，也就形成一种罪。但这种罪是佛陀制戒，经由出家众受戒犯戒之后，才成立的，不是通于一般人。所以叫做“遮罪”。
出家众犯了戒，有了遮罪，按照戒律的规定，必须作法忏才能灭除。这在戒律里是很强调的。遮罪是因戒——犯戒而有，当然，也就必须按照戒律的规定，经由作法忏悔，才能灭除了。
二、取相忏的所依所治
再谈到取相忏的所依和所治。
就一般来说，取相忏是要比作法忏来得困难了。因为一个造了罪业的人，能够见到佛菩萨的瑞相，那就表示，他的忏悔已经发生了效果，罪业已经消亡；不仅如此，连带的，他的妄想、烦恼更是已经淡薄，乃至消失，身心入于静定中了。如此，才有可能见到瑞相。瑞相的产生，虽然不能说全是唯心，但如果内心不清净，就如一潭混浊的湖水，再大再明的月亮，也不可能映现于水上。所以，取相忏就不像作法忏，可以在一时之间完成。它可能必须经过几天、几月或几年，甚至几十年长久时间的忏悔．才能达成。
但是，有一份的耕耘．就会有一份的收获，取相忏所能够灭除的罪业，就比作法忏广泛的多了，除了遮罪之外，各种罪业，包括性罪，也都可以得到灭除。
因此，梵网菩萨戒教犯了十戒的人．要从事取相忏，一旦得见好相，便能灭罪。十戒便是波罗夷重戒，包括：“一杀戒；二盗戒；三淫戒；四妄语戒；五酤酒戒；六说四众过戒；七自赞毁他戒；八悭惜加毁戒；九嗔心不受悔戒；十谤三宝戒。这十戒中有遮有性，犯了十戒的罪，可能是遮罪，也可能是遮罪加上性罪，譬如：杀生、偷盗、邪淫，便是各具遮性双罪。遮罪可以经由作法忏而灭除，但性罪仍然存在；而取相忏则可以双灭遮性二罪，自然是比作法忏殊胜了。
从事于取相忏时，不单只是忏悔，还是一种修行。在不断的礼佛忏悔之下，无形中，就会具足戒行，乃至进入禅定；再由戒行与禅定的功德，而达成了取相忏。
三、无生忏的所依所治
取相忏虽功效比作法忏来得殊胜，但仍然不够究竟。
取相忏与作法忏都是建立在有恶业（罪业）的前提下，来从事忏悔的。因为有恶业——承认自己造了恶业，所以，必须忏悔，以求消除恶业。这种观念，似乎天经地义般，不觉得有什么错；然而，仔细探究起来，就会发现是有问题的。
既然有恶业——恶业是存在的，那么又怎么能够灭除它呢？反过来说，如果恶业是可以经由忏悔而得灭除，那么，这恶业就不是真正的恶业了；否则，在道理上是说不通的。因为，既是有恶业的存在，又说恶业可以经由忏悔而灭除，这不是自相矛盾吗？存在的，就不可能灭除，它会永远的存在，这才是真正的存在。恶业既然能够由忏悔而灭除，那么，恶业的存在并非是真实、不是有自性的存在。如此，恶业不过是个虚幻的东西；虚幻的，才能够加以灭除。
但是，恶业既然是虚幻的，也就是空的。空的还用忏悔吗？因此，只要我们了解到恶业的真相，知道恶业的不实，无形中，恶业就消失了，不必我们再去忏悔。所以，常被忏悔者引用的《观普贤菩萨行法经》说：“若欲忏悔者，端坐念实相，众罪如霜露，慧日能消除。”这段偈所表达的就是无生忏的道理。
无生忏和作法忏、取相忏不同的是：它要从根本上否定罪业的存在，以达到不见罪业，也不用忏悔的境界，而自然达成了忏悔的目的。这就需要智慧了，在智慧的观照之下，才能够照见诸法实相，了知罪业不可得，作者、受者更是不可得。所以，无生忏是依慧而设立的。
从戒定慧三学来说，慧的层次是高于定和戒的；慧也是持戒、修定所要达到的目的。同时，戒与定都不是究竟，唯有慧，才是究竟的；戒与定只是修行上要达到慧的一种前方便。那么，依戒而立的作法忏，和依定而立的取相忏，自然也就不如依慧而立的无生忏，来得究竟与圆满了。
所以，作法忏只能忏除遮罪，取相忏则能忏除遮性双罪，而无生忏除了能忏除遮性诸罪之外，连最重要的五逆罪：杀父、害母、杀害阿罗汉、破和合僧团、恶意出佛身血也都可以忏除。譬如：佛世有位“阿阇世王”，因为听信提婆达多的教唆，便将父王杀害，夺取王位，然后，自立为王。不久，果报现前，身上长疮，痛苦异常，虽有后悔之心，无奈恶业已成，无法挽救了，自认是地狱中人。但后来见了佛陀，在佛陀睿智分析之下，令他觉悟到：被杀者、乃至杀者本身都不可得，那里有罪业呢？于是，本来必须堕入五无间地狱受报的五逆罪，就在无生理观之下，重报轻受的过去了。
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